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    從鼠尾或其他小樣本中制備基因組DNA

    發(fā)布時間: 2021-12-20  點擊次數: 1532次

    原理

    這一簡單的實驗方案在成百上千的實驗室被廣泛應用于轉基因或基因剔除小鼠的基因型鑒定以及從小量培養(yǎng)的細胞或組織塊中提取 DNA。

    材料與儀器

    蛋白酶 K 培養(yǎng)的細胞 鼠尾或小鼠組織
    乙醇 異丙醇 酚 氯仿 異戊醇 磷酸鹽緩沖溶液 SNET TE
    Sorvall 離心機及 H1000B、SH-3000 轉頭 聚丙烯管 振蕩平臺 振蕩平臺或振動孵箱 Shepherd 氏鉤

    步驟

    一、材料

    1. 緩沖液及溶液

    乙醇

    異丙醇

    酚:氯仿:異戊醇(25:24:1 V/V)

    磷酸鹽緩沖溶液

    SNET(20 mmol/L Tris-Cl ( pH 8.0),5 mmol/L EDTA ( pH 8.0),400 mmol/L NaCl,1% (m/V) SDS)

    TE ( pH 8.0)

    2. 酶及緩沖液

    蛋白酶 K ( 20 mg/ml)

    Sorvall 離心機及 H1000B、SH-3000 轉頭(或其他相當的設備)

    3. 專用設備

    聚丙烯管(17 X 100 mm)

    室溫及 4℃ 振蕩平臺

    預設為 55℃ 的振蕩平臺或振動孵箱

    Shepherd 氏鉤

    4. 細胞和組織

    培養(yǎng)的細胞

    鼠尾或小鼠組織

    二、方法

    1. 準備適量的裂解緩沖液,即在 SNET 中加入蛋白酶 K 使終濃度為 400 μg/ml 向鼠尾或其他組織中加入裂解緩沖液。

    2. 管子垂直放置于振蕩平臺或振動恒溫箱中 55℃ 放置過夜。

    消化過程中樣品的充分混合是非常重要的。過夜消化后,應當看不到組織或鼠尾,緩沖液呈灰色乳狀液。

    3. 加入等體積的酚: 氯仿: 異戊醇,密閉管口,室溫下置于振蕩平臺 30 min。

    4. 離心分離有機相和水相。17X100 mm 的 Falcon 聚丙烯管中的樣品室溫下 666 g 離心 5 min, 即帶有旋轉桶的 Sorvall H1000B 轉頭 1800 r/min 或 Sorvall SH3000 旋轉桶 1600 r/min。對于較小體積的樣品,樣品置于微量離心管中室溫下用最大轉速離心 5 min。轉移上層水相至一新的 Falcon 管或微量離心管中。

    5. 加入等體積的異丙醇沉淀 DNA。4℃,13250 g 離心(8000 r/min,Sorvall 3000 轉頭或微量離心管中用最大轉速)15 min 收集沉淀的 DNA。

    6. 小心除去異丙醇。將 DNA 沉淀浸于 1 ml 70% 的乙醇里。如果沉淀較松散,再離心 5 min。除去 70% 的乙醇,室溫下空氣中干燥沉淀約 15~20 min。

    不要讓 DNA 沉淀*干操,否則極難溶解。

    7. 加入 0.5 ml TE, 4℃ 下輕柔振蕩過夜使核酸沉淀溶解。

    8. 將溶液轉移到微量離心管中,室溫保存。

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